WO2024218557 - ARTIFICIAL INTELLIGENCE-BASED METHOD AND SYSTEM FOR PREDICTING MUTATION TRAJECTORIES OF PATHOGEN EVOLUTION

National phase entry is expected:
Publication Number WO/2024/218557
Publication Date 24.10.2024
International Application No. PCT/IB2023/056919
International Filing Date 04.07.2023
Title **
[English] ARTIFICIAL INTELLIGENCE-BASED METHOD AND SYSTEM FOR PREDICTING MUTATION TRAJECTORIES OF PATHOGEN EVOLUTION
[French] PROCÉDÉ ET SYSTÈME BASÉS SUR L'INTELLIGENCE ARTIFICIELLE POUR PRÉDIRE DES TRAJECTOIRES DE MUTATION DE L'ÉVOLUTION D'AGENTS PATHOGÈNES
Applicants **
NEC LABORATORIES EUROPE GMBH Kurfuersten-Anlage 36 69115 Heidelberg, DE
Inventors
ONORO-RUBIO, Daniel c/o NEC Laboratories Europe GmbH Kurfuersten-Anlage 36 69115 Heidelberg, DE
SIARHEYEU, Raman c/o NEC Laboratories Europe GmbH Kurfuersten-Anlage 36 69115 Heidelberg, DE
Priority Data
63/496,420   17.04.2023   US
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Application details
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Quotation for National Phase entry

Country StagesTotal
China Filing1078
EPO Filing, Examination4684
Japan Filing530
South Korea Filing575
USA Filing, Examination2635
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Total: 9502

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Abstract[English] A computer-implemented method for predicting pathogen evolution includes computing a mutation trajectory of an input sample of a pathogen to be simulated by iteratively determining an update to a vector of changes based on a gradient that is computed with respect to the input sample using a loss associated with a prediction output of a trained differentiable surrogate model. Then, the method includes reconstructing changes to the input sample based on the iterative updates to obtain a predicted pathway of the pathogen evolution. The present invention can be used in a variety of applications including, but not limited to, several anticipated use cases in medical diagnostics/applications and in healthcare.[French] L'invention concerne un procédé mis en œuvre par ordinateur pour prédire l'évolution d'un agent pathogène consistant à calculer une trajectoire de mutation d'un échantillon d'entrée d'un agent pathogène à simuler en déterminant itérativement une mise à jour d'un vecteur de changements sur la base d'un gradient qui est calculé par rapport à l'échantillon d'entrée à l'aide d'une perte associée à une sortie de prédiction d'un modèle de substitution différentiable entraîné. Ensuite, le procédé consiste à reconstruire des changements à l'échantillon d'entrée sur la base des mises à jour itératives pour obtenir un trajet prédit de l'évolution de l'agent pathogène. La présente invention peut être utilisée dans diverses applications comprenant, entre autres, plusieurs cas d'utilisation anticipée dans les diagnostics médicaux/applications médicales et dans les soins de santé.
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