WO2023209614 - GUIDE DESIGN AND OFF-TARGET SEARCHES
National phase entry is expected:
Publication Number
WO/2023/209614
Publication Date
02.11.2023
International Application No.
PCT/IB2023/054329
International Filing Date
27.04.2023
Title **
[English]
GUIDE DESIGN AND OFF-TARGET SEARCHES
[French]
CONCEPTION DE GUIDE ET RECHERCHES HORS CIBLE
Applicants **
CRISPR THERAPEUTICS AG
Inventors
TOOMEY, John Michael
SPENCER, Sarah J.
Priority Data
63/335,388
27.04.2022
US
Application details
| Total Number of Claims/PCT | * |
| Number of Independent Claims | * |
| Number of Priorities | * |
| Number of Multi-Dependent Claims | * |
| Number of Drawings | * |
| Pages for Publication | * |
| Number of Pages with Drawings | * |
| Pages of Specification | * |
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| Number of Office Actions | * |
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International Searching Authority |
EPO
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| Recordal of a Change of the Applicant's Name/Address |
Change of Applicant's Name and Address
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| Type of Assignment |
The Standard Agent's Assignment
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| Applicant's Legal Status |
Legal Entity
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| Entry into National Phase under |
Chapter I
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| Patent Delivery |
Send the Letters Patent by Courier
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| Translation |
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Quotation for National Phase entry
| Country | Stages | Total | |
|---|---|---|---|
| China | Filing, Examination, Granting | 4375 | |
| EPO | Filing, Examination, Granting | 61304 | |
| Japan | Filing, Examination, Granting | 4038 | |
| South Korea | Filing, Examination, Granting | 5907 | |
| USA | Filing, Examination, Granting | 18790 |
Total:
94,414
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Abstract[English]
Disclosed herein include systems, devices, and methods for determining a protospacer sequence. For each of protospacer sequences, homology strings of the protospacer sequence can be generated. Each of the homology strings can be mapped to a reference sequence sequence to determine a match of the homology string in the reference sequence. Matches of one or more of the homology strings of can be filtered based on a protospacer adjacent motif (PAM) space to determine one or more off-target sites of the protospacer sequence. A profile of each protospacer sequence can be determined using the off-target sites of the protospacer sequence. A protospacer sequence can be selected based on its profile. A guide comprising the selected protospacer sequence can be designed and used for gene editing.[French]
Des systèmes, des dispositifs et des procédés pour déterminer une séquence de protoespaceur sont divulgués dans la présente invention. Pour chacune des séquences de protoespaceur, des chaînes d'homologie de la séquence de protoespaceur peuvent être générées. Chacune des chaînes d'homologie peut être mappée à une séquence de référence pour déterminer une correspondance de la chaîne d'homologie dans la séquence de référence. Des correspondances d'une ou de plusieurs chaînes parmi les chaînes d'homologie peuvent être filtrées sur la base d'un espace de motif adjacent de protoespaceur (PAM) pour déterminer un ou plusieurs sites hors cible de la séquence de protoespaceur. Un profil de chaque séquence de protoespaceur peut être déterminé à l'aide des sites hors cible de la séquence de protoespaceur. Une séquence de protoespaceur peut être sélectionnée sur la base de son profil. Un guide comprenant la séquence de protoespaceur sélectionnée peut être conçu et utilisé à des fins d'édition de gènes.