WO2023180962 - PROGRAMMATIC PROCESSING OF PROTEIN OR NUCLEIC ACID SEQUENCES TO IDENTIFY MUTATIONS AT PROGRAMMATICALLY DETERMINED SUBSEQUENCES

National phase entry:
Publication Number WO/2023/180962
Publication Date 28.09.2023
International Application No. PCT/IB2023/052825
International Filing Date 22.03.2023
Title **
[English] PROGRAMMATIC PROCESSING OF PROTEIN OR NUCLEIC ACID SEQUENCES TO IDENTIFY MUTATIONS AT PROGRAMMATICALLY DETERMINED SUBSEQUENCES
[French] TRAITEMENT PROGRAMMATIQUE DE SÉQUENCES DE PROTÉINES OU D'ACIDES NUCLÉIQUES POUR IDENTIFIER DES MUTATIONS AU NIVEAU DE SOUS-SÉQUENCES DÉTERMINÉES PAR PROGRAMMATION
Applicants **
WATERS TECHNOLOGIES IRELAND LIMITED
Inventors
GEROMANOS, Scott J.
HOYES, Emmy Maria
TRACEY, Francis
CASWELL, Allen
GAO, Ming
Priority Data
63/322,506   22.03.2022   US
Application details
Total Number of Claims/PCT *
Number of Independent Claims *
Number of Priorities *
Number of Multi-Dependent Claims *
Number of Drawings *
Pages for Publication *
Number of Pages with Drawings *
Pages of Specification *
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Number of Office Actions *
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International Searching Authority
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Recordal of a Change of the Applicant's Name/Address
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Type of Assignment
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Applicant's Legal Status
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Entry into National Phase under
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Patent Delivery
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Translation

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Quotation for National Phase entry

Country StagesTotal
China Filing, Examination, Granting2202
EPO Filing, Examination, Granting10786
Japan Filing, Examination, Granting2338
South Korea Filing, Examination, Granting2320
USA Filing, Examination, Granting4740
MasterCard Visa
Total: 22,386

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Abstract[English] The exemplary embodiments may obtain protein, gene sequence or nucleic acid sequences from data sources, process the sequences with a processor executing computer programming instructions to identify mutations and display information regarding the mutations to a user on a display device. For protein sequences, the exemplary embodiments may identify which subsequences in the sequences are well suited for observing as positions in the sequences where possible mutations may arise. Statistical techniques may be applied to variations in the subsequences to determine whether the variations are mutations or not. The displayed information regarding each mutation may include the nature of the mutation, the frequency of the mutation, the location of the user having the mutation, the date that the sample was obtained and other information of interest.[French] Des modes de réalisation fournis à titre d'exemple permettent d'obtenir des séquences de protéines, des séquences de gènes ou d'acides nucléiques à partir de sources de données, de traiter les séquences avec un processeur exécutant des instructions de programmation informatique pour identifier des mutations et afficher des informations concernant les mutations à un utilisateur sur un dispositif d'affichage. Pour les séquences de protéines, les modes de réalisation fournis à titre d'exemple permettent d'identifier quelles sous-séquences dans les séquences sont appropriées pour les observer en tant que positions dans les séquences où de possibles mutations peuvent survenir. Des techniques statistiques peuvent être appliquées à des variations dans les sous-séquences pour déterminer si les variations sont des mutations ou non. Les informations affichées concernant chaque mutation peuvent comprendre la nature de la mutation, la fréquence de la mutation, l'emplacement de l'utilisateur ayant la mutation, la date à laquelle l'échantillon a été obtenu et d'autres informations d'intérêt.

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