WO2025158200 - METHOD FOR SPATIAL MAPPING OF CELL TARGETS
National phase entry is expected:
Publication Number
WO/2025/158200
Publication Date
31.07.2025
International Application No.
PCT/IB2024/062350
International Filing Date
07.12.2024
Title **
[English]
METHOD FOR SPATIAL MAPPING OF CELL TARGETS
[French]
PROCÉDÉ DE CARTOGRAPHIE SPATIALE DE CIBLES CELLULAIRES
Applicants **
PIXELGEN TECHNOLOGIES AB
Inventors
FREDRIKSSON, Simon
KARLSSON, Filip
SIMONETTI, Michele
Priority Data
63/625,080
25.01.2024
US
Application details
| Total Number of Claims/PCT | * |
| Number of Independent Claims | * |
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International Searching Authority |
EPO
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| Recordal of a Change of the Applicant's Name/Address |
Change of Applicant's Name and Address
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| Type of Assignment |
The Standard Agent's Assignment
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| Applicant's Legal Status |
Legal Entity
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| Entry into National Phase under |
Chapter I
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| Patent Delivery |
Send the Letters Patent by Courier
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| 译文 |
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Quotation for National Phase entry
| Country | Stages | Total | |
|---|---|---|---|
| China | Filing, Examination, Granting | 3199 | |
| EPO | Filing, Examination, Granting | 24598 | |
| Japan | Filing, Examination, Granting | 3079 | |
| South Korea | Filing, Examination, Granting | 3945 | |
| USA | Filing, Examination, Granting | 12140 |
Total:
46,961
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Abstract[English]
Provided herein is a method for producing a map of binding events. In some embodiments, this method may comprise: obtaining a sample that comprises uniquely barcoded RCA products that are tethered to the sample, hybridizing a grid oligonucleotide to the uniquely barcoded RCA products while they are tethered to the sample, wherein the 5' and 3' ends of the grid oligonucleotide hybridizes to different RCA products, extending the 5' and 3' ends of the grid oligonucleotide to copy unique molecular identifiers a target identifier sequences from the different RCA products onto the ends of the grid oligonucleotide to make an extended grid oligonucleotide; and sequencing the extended grid oligonucleotide to produce sequence reads. A map of the binding sites of the capture agent and the identities of the target to which the capture agent binds can be generated by analysis of the sequence reads.[French]
La présente invention porte sur un procédé de production d'une carte d'événements de liaison. Selon certains modes de réalisation, ce procédé peut comporter les étapes suivantes : obtention d'un échantillon comportant des produits RCA à code-barres unique fixés à l'échantillon ; hybridation d'un oligonucléotide de grille aux produits RCA à code-barres unique pendant qu'ils sont fixés à l'échantillon, les extrémités 5' et 3' de l'oligonucléotide de grille s'hybridant à des produits RCA différents ; allongement des extrémités 5' et 3' de l'oligonucléotide de la grille pour copier des identificateurs moléculaires uniques et des séquences d'identificateurs de cibles provenant des différents produits RCA sur les extrémités de l'oligonucléotide de la grille afin d'obtenir un oligonucléotide de la grille étendu ; et séquençage de l'oligonucléotide de la grille étendu afin de produire des lectures de séquence. Une carte des sites de liaison de l'agent de capture et les identités de la cible à laquelle l'agent de capture se lie peuvent être générées par analyse des lectures de séquence.