WO2023233256 - SYSTEMS AND METHODS FOR SEQUENCING DISSOCIATION SPECTRA OF OLIGONUCLEOTIDES OBTAINED BY NEGATIVE ELECTRON ACTIVATED DISSOCIATION

National phase entry:
Publication Number WO/2023/233256
Publication Date 07.12.2023
International Application No. PCT/IB2023/055445
International Filing Date 26.05.2023
Title **
[English] SYSTEMS AND METHODS FOR SEQUENCING DISSOCIATION SPECTRA OF OLIGONUCLEOTIDES OBTAINED BY NEGATIVE ELECTRON ACTIVATED DISSOCIATION
[French] SYSTÈMES ET PROCÉDÉS DE SÉQUENÇAGE DE SPECTRES DE DISSOCIATION D'OLIGONUCLÉOTIDES OBTENUS PAR DISSOCIATION ACTIVÉE PAR ÉLECTRONS NÉGATIFS
Applicants **
DH TECHNOLOGIES DEVELOPMENT PTE. LTD.
Inventors
BABA, Takashi
KARASAWA, Kaoru
Priority Data
63/347,946   01.06.2022   US
Application details
Total Number of Claims/PCT *
Number of Independent Claims *
Number of Priorities *
Number of Multi-Dependent Claims *
Number of Drawings *
Pages for Publication *
Number of Pages with Drawings *
Pages of Specification *
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Number of Office Actions *
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International Searching Authority
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Recordal of a Change of the Applicant's Name/Address
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Type of Assignment
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Entry into National Phase under
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Patent Delivery
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译文

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Quotation for National Phase entry

Country StagesTotal
China Filing, Examination, Granting2316
EPO Filing, Examination, Granting11165
Japan Filing, Examination, Granting2307
South Korea Filing, Examination, Granting2380
USA Filing, Examination, Granting4740
MasterCard Visa
Total: 22,908

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Abstract[English] A system for analyzing mass spectra of a deprotonated oligonucleotide comprises a mass spectrometer configured to collect mass spectrometry data and an analyzer module configured to receive and analyze the mass spectrometry data by identifying experimental isotopic peaks corresponding to a precursor ion generated from the deprotonated oligonucleotide; determining characteristics of the precursor ion; identifying experimental isotopic peaks corresponding to a fragment ion generated from the precursor ion; determining characteristics of the fragment ion; selecting a candidate fragment for the fragment ion; determining mass shifted isotopic peaks of the candidate fragment based on data that include the characteristics of the precursor ion and the characteristics of the fragment ion; comparing the experimental isotopic peaks corresponding to the fragment ion and the mass shifted isotopic peaks of the candidate fragment; and identifying the fragment ion as the candidate fragment based on the comparing.[French] L'invention porte sur un système d'analyse de spectres de masse d'un oligonucléotide déprotoné comprenant un spectromètre de masse conçu pour collecter des données de spectrométrie de masse et un module d'analyseur conçu pour recevoir et analyser les données de spectrométrie de masse par identification de pics isotopiques expérimentaux correspondant à un ion précurseur généré à partir de l'oligonucléotide déprotoné ; par détermination de caractéristiques de l'ion précurseur ; par identification des pics isotopiques expérimentaux correspondant à un ion fragment généré à partir de l'ion précurseur ; par détermination des caractéristiques de l'ion fragment ; par sélection d'un fragment candidat pour l'ion fragment ; par détermination des pics isotopiques décalés en masse du fragment candidat sur la base de données qui comprennent les caractéristiques de l'ion précurseur et les caractéristiques de l'ion fragment ; par comparaison des pics isotopiques expérimentaux correspondant à l'ion fragment et des pics isotopiques décalés en masse du fragment candidat ; et par identification de l'ion fragment en tant que fragment candidat sur la base de la comparaison.