IP-Coster | WO2024033174 | BARCODING OF NUCLEIC ACIDS FROM SINGLE CELLS

Country	Stages	Total
China	Filing, Examination, Granting	2139
EPO	Filing, Examination, Granting	8705
Japan	Filing, Examination, Granting	2141
South Korea	Filing, Examination, Granting	1995
USA	Filing, Examination, Granting	5340

Abstract[English] The invention provides a method which allows the separation of different workflow steps for barcoding of target nucleic acids and therefore providing optimal reaction conditions for each workflow step, especially for template switching reactions. Moreover this method provides the opportunity to perform the reactions such as barcoding reactions of two different nucleic acid molecules from one cell such as RNA and genomic DNA molecules in a single step. The method comprises the steps: (a) Providing a plurality of cells comprising target RNA molecules and at least one solid support comprising capture oligonucleotides for said target RNA molecules and barcode oligonucleotides; (b) Partitioning said plurality of cells and said solid supports such that each cell is included into a separate partition and each partition comprises a solid support; (c) Lysing said cell, thereby obtaining a mixture of target and non¬ target RNA molecules; (d) Hybridizing said target RNA molecules to the capture oligonucleotides for said target RNA molecules, thereby obtaining target RNA molecules attached to said solid support (e) Disrupting the partitions and separating the non-target RNA molecules from the target RNA molecules attached to said solid support (f) Generating double stranded nucleic acids from the target RNA molecules by nucleic acid synthesis, wherein the capture oligonucleotides serve as primer and the target RNA molecules serve as templates (g) Attaching the barcode oligonucleotides to the double stranded nucleic acids from target RNA molecules, thereby generating barcoded nucleic acids from target RNA molecules; Characterized in that in step a) said plurality of cells additionally comprise target genomic DNA molecules and said at least one solid support additionally comprise capture oligonucleotides for target genomic DNA molecules and in that the capture oligonucleotides for target RNA and target genomic DNA molecules are different.[French] L'invention concerne un procédé permettant de séparer les différentes étapes du flux de travail pour le codage à barres des acides nucléiques cibles et donc de fournir des conditions de réaction optimales pour chaque étape du flux de travail, en particulier pour les réactions de commutation de matrice. En outre, ce procédé permet d'effectuer en une seule étape des réactions telles que le codage à barres de deux molécules d'acide nucléique différentes provenant d'une même cellule, telles que des molécules d'ARN et d'ADN génomique. Le procédé comprend les étapes suivantes : (a) mise à disposition d'une pluralité de cellules comprenant des molécules d'ARN cible et au moins un support solide comprenant des oligonucléotides de capture pour lesdites molécules d'ARN cible et des oligonucléotides de code-barres; (b) division de ladite pluralité de cellules et desdits supports solides de sorte que chaque cellule soit incluse dans une division séparée et que chaque division comprenne un support solide; (c) lyse de ladite cellule, obtenant ainsi un mélange de molécules d'ARN cible et de molécules d'ARN non cible; (d) hybridation desdites molécules d'ARN cible aux oligonucléotides de capture pour lesdites molécules d'ARN cible, obtenant ainsi des molécules d'ARN cible fixées audit support solide; (e) perturbation des divisions et séparation des molécules d'ARN non cible des molécules d'ARN cible fixées audit support solide; (f) production d'acides nucléiques double brin à partir des molécules d'ARN cible par synthèse d'acide nucléique, les oligonucléotides de capture servant d'amorce et les molécules d'ARN cible servant de matrice; (g) fixation des oligonucléotides de code-barres aux acides nucléiques double brin des molécules d'ARN cible, produisant ainsi des acides nucléiques à code-barres à partir des molécules d'ARN cible. Le procédé est caractérisé par le fait qu'à l'étape a), ladite pluralité de cellules comprend en outre des molécules d'ADN génomique cible et ledit au moins un support solide comprend en outre des oligonucléotides de capture pour les molécules d'ADN génomique cible et par le fait que les oligonucléotides de capture pour l'ARN cible et les molécules d'ADN génomique cible sont différents.

Total Number of Claims/PCT	*
Number of Independent Claims	*
Number of Priorities	*
Number of Multi-Dependent Claims	*
Number of Drawings	*
Pages for Publication	*
Number of Pages with Drawings	*
Pages of Specification	*
Sequence Listing	*
Number of Office Actions	*
International Search Report is established	*
International Searching Authority	EPO *
Recordal of a Change of the Applicant's Name/Address	Change of Applicant's Name and Address *
Type of Assignment	The Standard Agent's Assignment *
Applicant's Legal Status	Legal Entity *
Small Entity	*
Non-Commercial Organization	*
Micro Entity	*
Small Entity, USA	*
Micro Entity, USA	*
Entry into National Phase under	Chapter I *
Patent Delivery	Send the Letters Patent by Courier *
Translation

WO2024033174 - BARCODING OF NUCLEIC ACIDS FROM SINGLE CELLS

Quotation for National Phase entry

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